Ученые пришли к выводу, что Кракатау извергался много раз за всю историю своего существования. Эти извержения изменяли внешний облик не только самого вулкана и острова, на котором он расположен, но и окружающей области. В частности, многие ученые предполагают, что Зондский пролив был сформирован после очередного извержения Кракатау. Как известно, впервые Зондский пролив упоминался в отчетах арабских моряков приблизительно в 1100 годах нашей эры.

Самые ранние извержения Кракатау, которые были упомянуты в тех или иных исторических хрониках различных стран региона:
-Извержение 416 года нашей эры было упомянуто в Книге Яванский Царей, известной, как Раджа Пустака. Согласно записи в книге, громоподобный звук происходил из горы Бэтувара (потухший вулкан известный в настоящее время, как Пулосари), ему вторил подобный звук из горы Капи, которая расположена на запад от современного Бантама (самая западная область на острове Ява). Затем большой «пылающий огонь достиг неба, выйдя из горы». «Весь мир стал трястись, и пошел проливной дождь, а на море обрушились шторма». Но ни проливной дождь, ни шторм, не смогли погасить извержение Кракатау, который извергался с ужасным ревом и, в конце концов, разорвался на части, исчезнув под землей. Уровень воды повысился и затопил остатки. Жители той страны, что располагалась вокруг вулкана, погибли.

— Извержение Кракатау 535 года: Многие ученые соглашаются с тем, что извержение Кракатау, произошедшее в 535 году, привело к глобальному изменению климата на нашей планете в 535 – 536 годах. В древних источниках почти нет информации об этом извержении, однако, современные исследования дают возможность не только экспериментально определить даты значительных извержений этого вулкана, но и изучить последствия и влияния этих извержений на жизнь на планете.

Согласно последним исследованиям ученых, в период между 9-ым и 16-ым столетиями семь извержений Кракатау были мощными и оставили свой след в окружающей области. Эти извержения произошли в 850 г., 950 г., 1050 г., 1150 г., 1320 г. и 1530 г.